MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5

Total Repeats: 3196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009930	GCA	2	6	25248	25253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340945
502	NC_009930	CCA	2	6	25269	25274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340945
503	NC_009930	AAG	2	6	25275	25280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340945
504	NC_009930	CTGT	2	8	25325	25332	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_009930	TTC	2	6	25420	25425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340946
506	NC_009930	T	7	7	25453	25459	0 %	100 %	0 %	0 %	158340946
507	NC_009930	ATA	2	6	25640	25645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340946
508	NC_009930	AATA	2	8	25705	25712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009930	AAT	2	6	25716	25721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009930	AT	3	6	25735	25740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009930	TAT	2	6	25745	25750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009930	ACA	2	6	25759	25764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_009930	CAC	2	6	25854	25859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340947
514	NC_009930	ATGGTG	2	12	25918	25929	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340947
515	NC_009930	ACT	2	6	26013	26018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340947
516	NC_009930	AAAC	2	8	26228	26235	75 %	0 %	0 %	25 %	158340948
517	NC_009930	GCA	2	6	26314	26319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340948
518	NC_009930	CAA	2	6	26576	26581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009930	GTG	2	6	26731	26736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340949
520	NC_009930	CGT	2	6	26877	26882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340949
521	NC_009930	GGC	2	6	26940	26945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340949
522	NC_009930	ACG	2	6	26947	26952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340949
523	NC_009930	CTG	2	6	27015	27020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340950
524	NC_009930	GAA	2	6	27032	27037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340950
525	NC_009930	ACA	2	6	27068	27073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340950
526	NC_009930	ACA	2	6	27093	27098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340950
527	NC_009930	CCT	2	6	27108	27113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340950
528	NC_009930	CTG	2	6	27135	27140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340950
529	NC_009930	ATC	2	6	27243	27248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340950
530	NC_009930	CAG	2	6	27309	27314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340950
531	NC_009930	ATG	2	6	27335	27340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340950
532	NC_009930	CAA	2	6	27418	27423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_009930	GAA	2	6	27694	27699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340951
534	NC_009930	CTCA	2	8	27772	27779	25 %	25 %	0 %	50 %	158340951
535	NC_009930	TCC	2	6	27863	27868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340951
536	NC_009930	TGAG	2	8	27962	27969	25 %	25 %	50 %	0 %	158340951
537	NC_009930	AGA	2	6	27999	28004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340951
538	NC_009930	AGC	2	6	28083	28088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340951
539	NC_009930	GTG	2	6	28228	28233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340951
540	NC_009930	TGT	2	6	28241	28246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340951
541	NC_009930	GGAT	2	8	28286	28293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009930	TGC	2	6	28474	28479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340952
543	NC_009930	C	6	6	28529	28534	0 %	0 %	0 %	100 %	158340952
544	NC_009930	GTG	2	6	28586	28591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340952
545	NC_009930	ACCT	2	8	28634	28641	25 %	25 %	0 %	50 %	158340952
546	NC_009930	ATCTCA	2	12	28739	28750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340953
547	NC_009930	CGA	2	6	28773	28778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340953
548	NC_009930	GGA	2	6	28796	28801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340953
549	NC_009930	AAAG	2	8	28844	28851	75 %	0 %	25 %	0 %	158340953
550	NC_009930	CAC	2	6	28933	28938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340953
551	NC_009930	AACGAT	2	12	28970	28981	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340953
552	NC_009930	T	7	7	29235	29241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009930	CTC	2	6	29375	29380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340954
554	NC_009930	GAA	3	9	29387	29395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340954
555	NC_009930	GAT	2	6	29446	29451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340954
556	NC_009930	TGG	2	6	29469	29474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340954
557	NC_009930	AAG	2	6	29486	29491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340954
558	NC_009930	GCA	2	6	29535	29540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340954
559	NC_009930	CTG	2	6	29553	29558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340954
560	NC_009930	TGG	2	6	29609	29614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340954
561	NC_009930	CTAT	2	8	29658	29665	25 %	50 %	0 %	25 %	158340954
562	NC_009930	TCA	2	6	29674	29679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340954
563	NC_009930	AAG	2	6	29702	29707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340954
564	NC_009930	CAG	2	6	29763	29768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340954
565	NC_009930	TCT	2	6	29825	29830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340954
566	NC_009930	CAGAA	2	10	29850	29859	60 %	0 %	20 %	20 %	158340954
567	NC_009930	AGA	2	6	29887	29892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340954
568	NC_009930	GCT	2	6	29894	29899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340954
569	NC_009930	CT	3	6	29898	29903	0 %	50 %	0 %	50 %	158340954
570	NC_009930	ATGG	2	8	29909	29916	25 %	25 %	50 %	0 %	158340954
571	NC_009930	GA	3	6	29969	29974	50 %	0 %	50 %	0 %	158340954
572	NC_009930	GCAA	2	8	30036	30043	50 %	0 %	25 %	25 %	158340954
573	NC_009930	GAA	2	6	30091	30096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340954
574	NC_009930	TAC	2	6	30229	30234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340955
575	NC_009930	CAA	2	6	30270	30275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340955
576	NC_009930	TGAT	2	8	30301	30308	25 %	50 %	25 %	0 %	158340955
577	NC_009930	TC	3	6	30315	30320	0 %	50 %	0 %	50 %	158340955
578	NC_009930	TTG	2	6	30348	30353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340955
579	NC_009930	AAG	2	6	30354	30359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340955
580	NC_009930	G	6	6	30369	30374	0 %	0 %	100 %	0 %	158340955
581	NC_009930	CT	3	6	30385	30390	0 %	50 %	0 %	50 %	158340955
582	NC_009930	ATG	2	6	30424	30429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340955
583	NC_009930	GA	3	6	30481	30486	50 %	0 %	50 %	0 %	158340955
584	NC_009930	GAC	2	6	30495	30500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340955
585	NC_009930	CAG	2	6	30549	30554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340955
586	NC_009930	A	7	7	30583	30589	100 %	0 %	0 %	0 %	158340955
587	NC_009930	ATTGA	2	10	30604	30613	40 %	40 %	20 %	0 %	158340955
588	NC_009930	TCT	2	6	30644	30649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340955
589	NC_009930	ACC	2	6	30685	30690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340955
590	NC_009930	CAT	2	6	30708	30713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340955
591	NC_009930	ATAGAA	2	12	30797	30808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158340955
592	NC_009930	TCC	2	6	30815	30820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340955
593	NC_009930	ATT	2	6	30829	30834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340955
594	NC_009930	AG	5	10	30844	30853	50 %	0 %	50 %	0 %	158340955
595	NC_009930	AAT	2	6	30875	30880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340955
596	NC_009930	AAG	2	6	30901	30906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340955
597	NC_009930	TTTC	2	8	30909	30916	0 %	75 %	0 %	25 %	158340955
598	NC_009930	GTA	2	6	30989	30994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340955
599	NC_009930	CCA	2	6	31019	31024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340955
600	NC_009930	TAT	2	6	31062	31067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340955
601	NC_009930	CCA	2	6	31106	31111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340955
602	NC_009930	ATCA	2	8	31135	31142	50 %	25 %	0 %	25 %	158340955
603	NC_009930	ATTT	2	8	31188	31195	25 %	75 %	0 %	0 %	158340955
604	NC_009930	GAA	2	6	31199	31204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340955
605	NC_009930	T	6	6	31235	31240	0 %	100 %	0 %	0 %	158340955
606	NC_009930	AGCC	2	8	31283	31290	25 %	0 %	25 %	50 %	158340955
607	NC_009930	CTT	2	6	31319	31324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340955
608	NC_009930	CATG	2	8	31462	31469	25 %	25 %	25 %	25 %	158340955
609	NC_009930	ACA	2	6	31487	31492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340955
610	NC_009930	GATT	2	8	31581	31588	25 %	50 %	25 %	0 %	158340955
611	NC_009930	A	6	6	31661	31666	100 %	0 %	0 %	0 %	158340955
612	NC_009930	AAAT	2	8	31679	31686	75 %	25 %	0 %	0 %	158340955
613	NC_009930	TCA	2	6	31698	31703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340955
614	NC_009930	ATTT	2	8	31863	31870	25 %	75 %	0 %	0 %	158340955
615	NC_009930	CCCT	2	8	31879	31886	0 %	25 %	0 %	75 %	158340955
616	NC_009930	CAG	2	6	31947	31952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340955
617	NC_009930	CAA	2	6	32008	32013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340955
618	NC_009930	GATT	3	12	32014	32025	25 %	50 %	25 %	0 %	158340955
619	NC_009930	A	6	6	32112	32117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009930	GAC	2	6	32224	32229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_009930	AG	3	6	32250	32255	50 %	0 %	50 %	0 %	158340956
622	NC_009930	TCC	2	6	32287	32292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340956
623	NC_009930	CAA	2	6	32332	32337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340956
624	NC_009930	ATC	2	6	32354	32359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340956
625	NC_009930	CAA	2	6	32488	32493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340956
626	NC_009930	TCC	2	6	32589	32594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340956
627	NC_009930	CCCA	2	8	32653	32660	25 %	0 %	0 %	75 %	158340956
628	NC_009930	GAG	2	6	32746	32751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340956
629	NC_009930	AC	3	6	32766	32771	50 %	0 %	0 %	50 %	158340956
630	NC_009930	TTA	2	6	32785	32790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340956
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885	NC_009930	TGT	2	6	46437	46442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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887	NC_009930	T	6	6	46489	46494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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889	NC_009930	ATG	2	6	46524	46529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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